Sekolah ini berdiri pada tahun 2001 dan menduduki bekas gedung SGO (Sekolah Guru Olahraga). Pendirian sekolah ini didasarkan pada peminat SMP Labschool Jakarta yang cukup banyak berdomisili di sekitar Jakarta Selatan, untuk menggampangkan mereka, maka dibangunlah sekolah ini pada tahun 2001, secara singkat berdirilah SMP Labschool Kebayoran.
Berada di sekitar Majestik Blok M atau tepatnya di jalan KH. Ahmad Dahlan No. 14 Kebayoran Baru Jakarta Selatan.
Sarana prasarana
Sekolah dilengkapi oleh sarana seperti : Laboratorium IPA terdiri atas laboratorium fisika, biologi, dan kimia, yang memungkinkan para siswa dapat melaksanakan praktikum di saat pembelajaran maupun di luar pembelajaran. Laboratorium bahasa Ruang ini dilengkapi dengan beragam perangkat elektronik seperti: elmorenik, televisi, video, dan perangkat radio kaset. Green House didukung oleh bermacam jenis tanaman penunjang pelajaran biologi. Tempat ini dipergunakan untuk bermacam penelitian yang berhubungan dengan materi biologi. Laboratorium Komputer , lapangan hall olah raga, lapangan rumput untuk sepak bola, lapangan konblok untuk basket, UKS, koperasi, plaza, kantin, pokoknya banyak sekali sarana yang disediakan di sekolah ini.